Na edición do milésimo aniversario das aventuras do mono alegre en Monkey Go Happy Stage 1000, xogarase o tema dos mil. O mono decidiu celebrar a graduación festiva visitando outra misteriosa cova, onde recibirá un samurái e un cabaleiro. O samurai perdeu as súas moedas de ouro e o cabaleiro perdeu o casco e a viseira. Pídenlle ao mono que os axude a atopar cousas perdidas e, ao mesmo tempo, desvele o segredo da cova. Está cheo de agochos e inscricións estrañas. Nas paredes hai nichos con forma que hai que encher con figuras do adorno correspondente en Monkey Go Happy Stage 1000.