Un tren especial que vai dende a Antártida ata a selva pode deixar de existir, e a razón débese ao deterioro das vías do ferrocarril. Os animais, temerosos de perder o único medio de transporte que lles permite viaxar, recorreron a Diego para pedir axuda en Go Diego Go! Salvamento Ferroviario de Diego. O neno está preparado para axudar, implicándoo na implementación do seu plan. Implica arranxar a estrada, pero primeiro hai que poñer todos os animais nos carruaxes. Os pasaxeiros aceptan viaxar só en compañía da súa especie, polo que hai un carruaje separado para pingüíns, corzos, osos, etc. Cando todos os animais estean colocados, o tren comezará a súa viaxe e antes de cada parada debes montar a estrada como un crebacabezas xirando tramos individuais en Go Diego Go! Salvamento Ferroviario de Diego.
