A cabeza é o que necesitas mentres viaxas polo mundo do xogo. Pero esta parte do corpo pódese usar de diferentes xeitos, incluso no que ofrece o xogo Head Run 3D. Para chegar á meta, e tamén para ir máis lonxe, debes axudar ao heroe a construír non os seus músculos, senón a súa cabeza. Isto é o que usará para romper obxectos na meta. Para facerche grande a cabeza, pasa por portas verdes positivas e evita os obstáculos que poden reducir os teus logros. Canto máis grande sexa a cabeza. Canto máis lonxe vai o teu heroe despois de cruzar a meta. A medida que acumulas cartos, compra melloras e equipa tamén unha casa para o heroe en Head Run 3D.
