Na antigüidade, a xente non tiña un só deus; crían en diferentes deuses, cada un dos cales era responsable da súa propia dirección. Os acontecementos do xogo Pyramid Puzzle teñen lugar no antigo Iegopt durante a época da lendaria raíña Cleopatra. Ela quere descubrir como o faraón falecido recentemente tiña habilidades especiais e se o gran deus Ra estivo implicado nisto. A raíña envía á súa fiel criada Hanna para que descubra os segredos do faraón, pero para iso necesita penetrar no interior da pirámide e mesmo visitar cuartos secretos, cuxa entrada está pechada aos estranxeiros. Axuda á rapaza a completar a tarefa. A raíña está esperando os resultados e será infeliz se non están no quebracabezas da pirámide.