A nave do alieníxena estrelouse nalgún lugar do deserto do afastado e descoñecido planeta Terra. O alieníxena non planeaba aterrar no noso planeta, pero a súa nave perdeu o control por unha colisión cun meteorito e estrelouse. O piloto conseguiu sobrevivir, pero a súa caída non pasou desapercibida. Os radares e satélites detectaron un obxecto descoñecido e os helicópteros voaron inmediatamente ao lugar do accidente. O alieníxena necesita escapar, non quere converterse nun obxecto de experimentación. Axúdao a correr rapidamente e saltar con habilidade sobre cactos e outros obstáculos, recollendo moedas. De cando en vez serás atrapado por un helicóptero e dispararás con mísiles en Alien Runner.
