En Ben 10: Brains vs Bugs terás que axudar a un divertido extraterrestre verde a liberar aos seus amigos secuestrados. Diante de ti, o teu personaxe será visible na pantalla, que estará situada nun lugar determinado. Usando as teclas de control guiarás as súas accións. O teu heroe terá que percorrer unha determinada ruta, superando varias trampas e outros perigos. No camiño, recollerá moedas de ouro e outros elementos útiles que che traerán puntos no xogo Ben 10: Brains vs Bugs e pode darlle ao personaxe varios tipos de bonos. Ademais, o teu personaxe terá que loitar contra os erros que se atoparán no seu camiño.
