Todos os que foron no mar deben de ver medusas. Son criaturas con forma de marmelada que nadan na columna de auga, moitas delas pican dolorosamente, polo que aos veraneantes non lles gustan demasiado as medusas. Pero no xogo Flappy Jelly axudarás a un deles e esta é unha medusa completamente inofensiva, polo que ten que esconderse dos numerosos inimigos que todos teñen no mundo submarino. Mentres tanto, a medusa necesita esconderse do temporal que se achega á zona. Ela non quere pasar o rato entre as ondas, así que decidiu nadar máis, pero acabou entre as ruínas dalgún templo antigo. Axuda ás medusas a superar os piares de mármore que sobresaen da parte superior e inferior da Flappy Jelly.