En dirección a un pequeno asentamento situado en Xapón, móvese un destacamento de ladróns. Aínda que matan aos veciños e saquean a aldea. Un valente guerreiro ninja levantouse para protexer aos veciños. Ti no xogo Phase Ninja axudarás ao heroe a loitar contra os viláns. Diante de ti na pantalla será visible a área na que estará o teu personaxe. Unha unidade inimiga moverase na súa dirección. Coa axuda de varias armas lanzadeiras e un arco con frechas, podes destruír oponentes a distancia. Cando o inimigo se achega, tiras a túa espada e participas nun combate corpo a corpo. Ao golpear cunha espada ao inimigo, destruirase e conseguirás puntos por el. Despois da morte dos inimigos, poderás coller trofeos que caerán deles.
