No fondo da selva vive un gorila chamado Donkey que sempre axuda aos seus amigos. Unha vez o noso personaxe decidiu ir visitar os seus parentes afastados que viven ao outro lado da selva. Vostede no xogo Super Donkey Kong 99 terá que axudar ao heroe nesta aventura. O teu personaxe será visible na pantalla diante de ti, que, baixo a túa dirección, avanzará polo camiño, collendo velocidade gradualmente. No camiño, o teu personaxe terá que recoller bananas e moedas de ouro espalladas por todo o lugar. Tamén terá que superar varias trampas e obstáculos que se atoparán no seu camiño.