Ata agora, Mario tiña que tratar só con cogomelos malvados, caracois e outros esbirros do seu eterno inimigo Bowser. Pero estas son só flores en comparación co que lle espera en Super Mario Commander. Un insidioso ataque desde o espazo fíxose inesperadamente ao Mundo de Mario. Criaturas temerosas e vizosas, armadas ata os dentes, causaron estragos no outrora pacífico reino. Mario terá que tomar unha arma seria e facer o papel dun superheroe. E para que teña éxito, axude ao fontaneiro a dominar un novo papel por si mesmo. É necesario limpar as plataformas de piratas espaciais e traer de novo o mundo á terra en Super Mario Commander.
